AG "mRNA Metabolismus"

Die Forschungsgruppe „mRNA-Metabolismus“ unter der Leitung von Prof. Dr. Andreas Kulozik beschäftigt sich mit der RNA-Biologie bei häufigen Erkrankungen, wie z.B. Hämoglobinerkrankungen, Thrombosen, entzündlichen Erkrankungen und pädiatrischen Krebserkrankungen. Dabei arbeiten die Forscher im Rahmen der MMPU (Molecular Medicine Partnership Unit) eng mit den Forschern unter der Leitung von Prof. Dr. Matthias Hentze am European Molecular Biology Laboratoy (EMBL) zusammen.

Wir interessieren uns im Speziellen für den Mechanismus des „nonsense-mediated mRNA decay“ (NMD, Abbau von mRNAs mit einem vorzeitigen Stopcodon), der als Qualitätskontrolle die Synthese fehlerhafter Proteine beschränkt sowie für die Regulation der 3‘-Endprozessierung von mRNAs bei zellulären Stressantworten.

Unsere Gruppe nutzt zellbiologische, molekularbiologische, biochemische sowie Transkriptom- und Proteom-basierte Techniken um die Funktion von RNA-Bindeproteinen (RBP) bei hämatologischen Erkrankungen und bei Krebserkrankungen und die Wirkung von Medikamenten auf diese Proteine zu untersuchen. Schlussendlich hoffen wir, Ansatzpunkte in der molekularen Entstehung von pädiatrischen Erkrankungen zu identifizieren, die es uns erlauben, Strategien für die Therapie dieser Erkrankungen zu entwickeln.


Mitarbeiter

  • Prof. Dr. Andreas Kulozik (Gruppenleiter)
  • PD Dr. rer. nat. Gabriele Neu-Yilik (Staff scientist)
  • Dr. Michael Backlund (Postdoc)
  • Dr. Daria Lavysh (Postdoc)
  • Dr. rer.nat. Yang Zhou (Postdoc)
  • Jonas Becker (Naturwiss. Doktorand)
  • Annika Brosig (Naturwiss. Doktorandin)
  • Beate Amthor (Technische Assistentin)
  • Nicole Dickemann (Technische Assistentin)
  • Margit Happich (Technische Assistentin)
  • Gabriele Tolle (Technische Assistentin)

Prof. Dr. med. Andreas Kulozik, PhD

Direktor "Klinische Pädiatrische Onkologie"

Postanschrift:
Klinik für Kinderonkologie, -hämatologie, -immunologie
Zentrum für Kinder- und Jugendmedizin
Jutta Mattern
Im Neuenheimer Feld 430
69120 Heidelberg

Ausgewählte Publikationen

1. Gabriele Neu-Yilik, Etienne Raimondeau, Boris Eliseev, Lahari Yeramala, Beate Amthor, Aurélien Deniaud, Karine Huard, Kathrin Kerschgens, Matthias W. Hentze, Christiane Schaffitzel, Andreas E. Kulozik EMBO J. 2017 Sep 12. Dual function of UPF3B in early and late translation termination,  doi: 10.15252/embj.201797079, PMID:28899899

2. Haberman N, Huppertz I, Attig J, König J, Wang Z, Hauer C, Hentze MW, Kulozik AE, Le Hir H, Curk T, Sibley CR, Zarnack K, Ule J. Genome Biol. 2017 Jan 16.  Insights into the design and interpretation of iCLIP experiments. doi: 10.1186/s13059-016-1130-x. PMID: 28093074

3. Hauer C, Sieber J, Schwarzl T, Hollerer I, Curk T, Alleaume AM, Hentze MW, Kulozik AE. Cell Rep. 2016 Aug 9.  Exon Junction Complexes Show a Distributional Bias toward Alternatively Spliced mRNAs and against mRNAs Coding for Ribosomal Proteins. doi: 10.1016/j.celrep.2016.06.096. Epub 2016 Jul 28. PMID: 27475226

4. Hollerer I, Curk T, Haase B, Benes V, Hauer C, Neu-Yilik G, Bhuvanagiri M, Hentze MW, Kulozik AE. RNA. 2016 Jul 12. The differential expression of alternatively polyadenylated transcripts is a common stress-induced response mechanism that modulates mammalian mRNA expression in a quantitative and qualitative fashion. PMID: 27407180

5. Sieber, J., Hauer, C., Bhuvanagiri, M., Leicht, S., Krijgsveld, J., Neu-Yilik, G., Hentze, M.W., Kulozik, A.E. Molecular & Cellular Proteomics 2016 Feb 20  Proteomic analysis reveals branch-specific regulation of the unfolded protein response by nonsense-mediated mRNA decay pii: mcp.M115.054056.

6. Danckwardt S, Gantzert AS, Macher-Goeppinger S, Probst HC, Gentzel M, Wilm M, Gröne HJ, Schirmacher P, Hentze MW, Kulozik AE. Mol Cell. 2011 Feb 4 p38 MAPK controls prothrombin expression by regulated RNA 3' end processing. doi: 10.1016/j.molcel.2010.12.032. PMID: 21292162

7. Danckwardt S, Hentze MW, Kulozik AE.
J Mol Med (Berl). 2013 Aug 17. Pathologies at the nexus of blood coagulation and inflammation: thrombin in hemostasis, cancer, and beyond. doi: 10.1007/s00109-013-1074-5. PMID: 23955016

8. Bhuvanagiri M, Lewis J, Putzker K, Becker JP, Leicht S, Krijgsveld J, Batra R, Turnwald B, Jovanovic B, Hauer C, Sieber J, Hentze MW, Kulozik AE.
EMBO Mol Med. 2014 Oct 15. 5-azacytidine inhibits nonsense-mediated decay in a MYC-dependent fashion.
pii: e201404461. doi: 10.15252/emmm.201404461.