KiTZ Data Commons
KiTZ Data Commons ist ein Webportal zu allen Datenplattformen, die Forschungsdaten zu Kinderkrebs aus KiTZ-Forschungsstudien enthalten. Es bietet Zugang zu molekularen Profilen und klinischen Merkmalen aus umfangreichen Projekten in der Kinderkrebsforschung.
Ziel ist es, diese Daten so offen wie möglich (und unter Einhaltung aller geltenden Datenschutzgesetze) mit Wissenschaftlern der pädiatrischen Onkologie zu teilen, um weitere biologische Erkenntnisse und die Umsetzung in klinische Anwendungen voranzubringen.
R2: Genomics analysis and visualization platform Pediatric PDX dataset section
Die hier dagestellten Daten gehören zur Abhandlung „Eine Biobank von 30 molekular charakterisierten orthotopen Xenotransplantatmodellen von Patienten für Hirntumoren bei Kindern“ von Brabetz et al. 2018.
R2: Genomics analysis and visualization platform DKFZ Pediatric Pan Cancer dataset section
Die hier dargestellten Daten gehören zur Publikation „Die Landschaft genomischer Veränderungen und Wirkstofftargets bei Krebserkrankungen im Kindesalter“ von Groebner et al. 2018.
R2: Genomics analysis and visualization platform datasets of ALT-positive neuroblastoma
Protein und RNA Expressionsdaten von Neuroblastom Tumoren mit alternative lengthening of telomeres (ALT) aus der Publikation Hartlieb et al. 2021.
R2 RNA-Daten ►
R2 Protein-Daten ►
Molekulare Landkarte kindlicher Tumoren
Die Heilungsraten für Krebserkrankungen im Kindesalter sind in den letzten Jahrzehnten auf etwa 80 Prozent gestiegen. Dennoch leidet ein großer Teil der überlebenden Kinder an schweren langfristigen Nebenwirkungen von Operationen, zytotoxischen Chemotherapien und Strahlentherapien, einschließlich geistiger Behinderungen und sekundären Krebsarten. Die Entwicklung spezifischerer Therapien mit weniger langfristigen Nebenwirkungen ist daher von größter Bedeutung.
Einer der entscheidenden Schritte in dieser Hinsicht ist die Identifizierung des genetischen Repertoires von bösartigen Erkrankungen bei Kindern. Dank neuester Technologien auf dem Gebiet der Genomsequenzierung ist es heute möglich, den gesamten genetischen und epigenetischen Code eines Tumors innerhalb weniger Tage zu entschlüsseln und damit die treibenden genetischen Anomalien innerhalb einzelner Entitäten und über pädiatrische Krebstypen hinweg zu identifizieren.
In unserer „Pediatric Pan-Cancer“-Studie (PedPanCan) untersuchen wir genetische Veränderungen in kindlichen Krebsarten auf verschiedenen Ebenen. Dazu gehört unter anderem die Analyse struktureller Variationen, Veränderungen in der Kopienzahl und kleiner Mutationen – sowohl in somatischen Zellen als auch in der Keimbahn. Außerdem wird ein mögliches Ansprechen der Proben auf bestimmte Wirkstoffe untersucht.
Im Gegensatz zu Krebsarten, die üblicherweise im Erwachsenenalter auftreten, sind kindliche Tumoren seltener und die Zahl der Mutationen im Genom der Krebszellen geringer. Daher ist es von besonderem wissenschaftlichem Wert, einen Überblick über mögliche molekulare Krebsauslöser und potenzielle Zielstrukturen für Medikamente zu gewinnen und der Wissenschaft zur Verfügung zu stellen.
Das KiTZ ist mit weiteren medizinischen Institutionen vernetzt, die ihre Daten für PedPanCan zur Verfügung stellen:
- Nationales Centrum für Tumorerkrankungen NCT
- Deutsches Konsortium für Translationale Krebsforschung DKTK
- St. Jude Children's Research Hospital
- ITCC – Innovative Therapies for Children with Cancer
- Universitätsklinikum Tübingen
- Eberhard Karls Universität Tübingen
- Krebscentrum Dresden
- Klinikum der Universität München
- Klinikums rechts der Isar München
- Universitätsklinikum Freiburg
- Charité Universitätsmedizin Berlin
- Universitäres Centrum für Tumorerkrankungen Frankfurt
- Universitäres Centrum für Tumorerkrankungen Mainz
- Westdeutsches Tumorzentrum Essen
Datendarstellung für Entwicklungsprogramme bei Neuroblastomen im Kindesalter
Online-Anwendung zur interaktiven Darstellung von Daten embryonaler und fetaler menschlicher Nebennieren-Einzelzellen und zum Vergleich mit einzelnen Neuroblastomzellen (Jansky et al. 2021).
Super-Enhancer-Landschaft des Neuroblastoms im Kindesalter
Online-Anwendung zur interaktiven Darstellung von Superverstärkern in primären Neuroblastomen und Zelllinien (Gartlgruber et al. 2020).
European Genome Phenome Archive
Die als Teil zweier Kollaborationsprojekte (Peifer et al.2015, Ackermann et al. 2018) zwischen Forschern des KiTZ und des Universitätsklinikums Köln zusammengestellten Hochdurchsatzdaten von Neuroblastom Tumoren sind beim EGA auf Anfrage verfügbar (Inventarnummer EGAS00001001308, EGAS00001003244).
Regulatorische Landschaft der Zellen im sich entwickelnden Kleinhirn der Maus
Online-Anwendung zur interaktiven Erforschung der Aktivität von cis-regulatorischen Elementen (CRE) in Zellen des sich entwickelnden Kleinhirns der Maus. Die Ergebnisse geben Einblicke in die Mechanismen, die zu Entwicklungsstörungen und pädiatrischen Hirntumoren führen.
(befindet sich im Aufbau)
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